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新冠病毒再现新变种XE，专家最新解读来了

百家作者：果壳 2022-04-05 12:51:21

据英国太阳报3月28日报道，英国卫生安全局(UKHSA)证实，目前已监测到一种新的新冠病毒突变株，名为XE，这是两种奥密克戎子毒株的重组变体。

目前已在英国境内发现了637例这种病例。

新冠病毒新变种XE有哪些关键特征？传染性是否增强？如何预防？

百度健康医典特邀百度健康医典特邀医典专家团成员首都医科大学附属北京地坛医院副院长、感染科主任医师蒋荣猛教授，知名科普大V、北海道大学神经科学硕士庄时利和为大家带来权威解读。

关于新冠病毒，我们需要了解的基础知识

在说XE之前，我们需要先来了解一些关于新冠病毒的基础知识。

新冠病毒本身的结构往简单里说，就是核酸加上外面一个蛋白质外壳。

新冠病毒的蛋白质又分为结构蛋白（structure protein）和非结构蛋白（nonstructure protein，缩写就是nsp）两部分。

结构蛋白就是我们听得比较多的刺突蛋白S、包膜蛋白E、膜蛋白M和核衣壳蛋白N这四种，它们是构成病毒颗粒所必须的蛋白质，而非结构蛋白有十几种，它们是病毒基因组编码的、在病毒复制过程中具有一定功能，但是不结合于病毒颗粒中的蛋白质。

图源：IBS[1]

咱们要是把新冠病毒的RNA拍扁了，大概就是图上这样。

很长的一节ORF1a/b基因（天蓝色/粉色），然后较长一节S基因（绿色）。

我相信很多人都有做过核酸检测（RT-PCR），核酸检测的最重要靶序列之一就是新冠病毒相对保守的ORF1a/b区域，几个变异体的突变都不影响核酸检测。

作为一种RNA病毒，新冠病毒本身是很容易出现突变的，但是大多数突变是无意义的，少部分会有负面影响，只有非常少的一些突变，会增强其传染性、致病性或免疫逃逸能力。

新冠病毒XE变异体是什么？

XE是今年2月15日在英国首次被发现。

基因测序的结果表明，XE的ORF1a部分更多是来自于Omicron的BA.1，而其余部分更多来自Omicron的BA.2，特别是S蛋白部分的基因——这也就意味着，其传播特性可能更接近BA.2。

图源：参考文献[2]

BA.2本身就是近年来发现传染性最强的病毒了。一种病毒的内生传染性，我们通常看R0，也就是在人群都没有免疫、没有防护的情况下，一个感染者能传染给几个人。R0越高传染性越大。

麻疹通常被当做病毒传染性的天花板，其R0是14~18。而BA.2的R0是多少目前没有准确答案，WHO的前传染病专家测算是12，上海的测算是9.5，总之都是远高于原始毒株和Delta，比Omicron BA.1也高了不少，中疾控的测算是比BA.1高了60%。

说回XE。

早期的数据表明XE的增长率（growth rate）比BA.2快了10%，但是后来的数据表明这一估计并不稳定，目前无法认定它更高的增长率是重组带来的优势。

另外增长率不同于R0，虽然两者都可以用来描述传染性的强弱。

其实也有很多种，比如在之前广东CDC发表的讲去年广州疫情的论文中，用的就是epidemic growth rate（r），r=[R0 -1]/GT）。

所以R0反映的是病毒的内生传染性，在现实当中我们会用Rt更准确一些（t=time），体现各种防疫措施对病毒实时传染性的影响。

Rt和r都是比较容易监测的，也都反映了病毒在真实世界的传染性，但它们和R0确实是不同的。

目前WHO和英国都未将其单独升级为一种VUI或VOC，说明影响力暂时没有那么高（就像之前一度在自媒体上炒得很火的Deltacron一样），目前只需要科研人员密切监测即可。

目前新冠病毒的其他变体还有哪些？

除了这几天在中文媒体上比较火的XE以外，我也看到其他一些变异体序列上传，顺便也说一下。

这些变异体主要是BA.2的分支，包括BA.2.4~BA.2.8，阿肯色州立大学副教授Raj Rajnarayanan在推上做了一些解析，供大家参考。

-BA.2.4：在新加坡发现，关键突变为ORF6:M58K，预测增长优势比BA.2和BA.1.1分别高了14%和46%；

-BA.2.5：在葡萄牙等国发现，关键突变为ORF1ab:P1018S，预测增长优势比BA.2和BA.1.1分别高了2%和49%；

-BA.2.6：在法国等国发现，关键突变为ORF3a:D27H，预测增长优势比BA.2和BA.1.1分别高了11%和62%；

-BA.2.7：在美国发现，关键突变为ORF1ab:T2124I ，预测增长优势比BA.2和BA.1.1分别高了13%和67%。

-BA.2.8：在英国发现，关键突变为ORF3a: T9K 及 ORF3a: A31T，预测增长优势比BA.2和BA.1.1分别高了34%和111%。

图源：cov-spectrum

目前这些变异体都只发现几百个序列，其增长优势的数据也是比较初步的，其中某种是否有可能会脱颖而出，成为下一个主要变异体，还需要进一步的观测。

新冠病毒的新变体传染性是否更强？如何有效预防?

初步认为，接下来的主要变异体可能在传染性上会比目前的BA.2更有优势，而至于其毒性会如何变化（增强或者减弱），这个目前很难准确预测。

如果真的有更强传染性变异体出现，这对现行防控策略来说又是一个新的挑战。

所以我们会发现，无论是XE，还是其他BA.2的分支变异体，其传染性可能正在BA.2的基础上增高。

目前这些新变异体的数量并不是很多，其中是否有可能有哪一种会发展为主要变异体还无法下结论，需要进一步密切观测，对于普通人来说，目前不需要过于恐慌。

而我更想和大家强调的是，面对这些BA.2的分支或者可能重组而来的变异体，疫苗接种仍然是相当关键的。

香港大学在两周前发表了一项非常重要的真实世界研究，表明面对免疫逃逸能力极强的BA.2，香港使用的两种疫苗在标准接种（两针）情况下，对于预防感染的有效率大幅降低，但是对于预防重症和死亡仍然保持较强的效果。而第三针疫苗接种后，保护力获得了全面提升：

图源：参考文献[3]

具体有效率可见图表，我们看看三针的有效率：

香港这波疫情的真实世界数据表明，面对BA.2，无论是哪种疫苗，三针接种对于预防重症及死亡仍然保持着强大的效力。

所以，对于大多数民众而言，这些新变异体的出现是必然的，但是不需要过于恐慌，因为目前这些变异体都没有上升至VOC（值得关注的变异体）的程度，对于我们国家也暂时没有影响。

最重要的是，没有打疫苗的尽快去打，能打第三针的话也尽快去打，疫苗在预防这些变异体的重症方面，仍然维持着强大的效力。

参考文献

[1].https://www.ibs.re.kr/cop/bbs/BBSMSTR_000000000738/selectBoardArticle.do?nttId=18344[2].https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/1063424/Tech-Briefing-39-25March2022_FINAL.pdf[3].Vaccine effectiveness of two and three doses of BNT162b2 and CoronaVac against2 COVID-19 in Hong Kong. https://doi.org/10.1101/2022.03.22.22272769

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